Приводятся результаты исследований современного и исторического накопления донных отложений в охраняемых карстовых озерах, расположенных в Зеленодольском районе Республики Татарстан. Установлено, что основные количественные параметры осадкообразования в Собакинских озерах остаются идентичными на протяжении последних 300 лет. Показатели ежегодного накопления взвешенного материала в озерах пропорциональны площади их водного зеркала. Современная скорость илонакопления в озерной системе составляет 1,4 мм/год. Тренд увеличения биогенной нагрузки на озера проявляется в заметном росте содержания органического вещества и соединений азота и фосфора в современных иловых отложениях.