Приведен обзор исследований макробеспозвоночных водоемов и водотоков бассейна Верхней Оби (юг Западной Сибири). Выделены основные периоды изучения зообентоса в зависимости от объема и целей проведенных работ. Исследования были направлены на определение таксономического разнообразия, количественных показателей и условий формирования донных сообществ под влиянием природных и антропогенных факторов. Значительные размеры водосборного бассейна Верхней Оби, труднодоступность некоторых его участков обуславливают значительную неоднородность уровня гидробиологических исследований отдельных частей бассейна.