В представленной работе на примере трех таксономических групп микроводорослей Псковского озера (сине-зеленых, зеленых и диатомовых) рассматривается влияние комплексных гидролого-гидрохимических условий среды на многолетнюю динамику биомассы. Кластерный анализ, выполненный на основе данных по многолетней дина- мике биомассы фитопланктона в Псковском озере, показал, что сине-зеленые водоросли отличаются наибольшим своеобразием, в то время как диатомовые и зеленые водоросли имеют значительное сходство. Приводится обоснование применения метода главных компонент как процедуры, позволяющей выполнить редукцию данных и создать независимые компоненты, при помощи которых значительно легче описать происходящие в системе закономерности. Перед проведением процедуры анализа производится проверка на мультиколлинеарность данных при помощи корреляционного анализа. В ходе анализа выявлено пять главных компонент, определяющих закономерности изменения биомассы фитопланктона. Показано, что сине-зеленые водоросли имеют наибольшую зависимость от температурного режима озера и содержания в воде растворенных минеральных и органических соединений, что вполне согласуется с данными, полученными другими авторами. Зеленые водоросли, по сравнению с сине-зелеными, более чувствительны к кислотно-щелочному балансу водной среды, а для комплекса диатомовых водорослей существенное значение имеет лишь уровенный режим и продолжительность последного периода.