Целенаправленное и систематическое изучение диатомовых водорослей в донных осадках Ладожского озера было начато в конце 50-х гг. ХХ в. в рамках работ Комплексной ладожской экспедиции Института озероведения РАН. Основные направления изучения диатомовых водорослей в ладожских отложениях были заложены и на протяжении большей части рассматриваемого периода развивались д.б.н. Натальей Наумовной Давыдовой (1931-2014). Ей был изучен систематический и эколого-географический состав диатомовых водорослей в поверхностном слое и колонках донных отложений, охарактеризованы основные этапы развития Ладожского озера в позднеледниковье-голоцене по данным диатомового анализа, прослежены стадии трансформации озерной экосистемы под воздействием антропогенного фактора, заложены основы геоэкологического мониторинга с использованием субфоссильных диатомовых комплексов. В настоящее время изучение диатомовых водорослей в ладожских отложениях продолжается по следующим направлениям: 1) получение новых данных и уточнение существующих представлений об основных этапах эволюции Ладожского озера и выявление биоиндикационных признаков изменений состояния ладожской экосистемы в геологическом прошлом; 2) продолжение ряда мониторинговых наблюдений за изменениями состава диатомовых комплексов в поверхностных осадках с целью изучения состояния Ладожского озера на современном этапе; 3) изучение отложений малых озер Приладожья с использованием модифицированного метода изоляционных бассейнов для реконструкции пространственно-временных рамок трансгрессивных стадий Ладожского озера.