Дереворазрушающие грибы играют важную роль в лесных экосистемах и приняты как один из биоиндикаторов их состояния. К настоящему времени на территории НП «Паанаярви» и его окрестностей зарегистрированы 166 видов из 89 родов афиллофоровых грибов. В изученных лесных экосистемах выявлены 34 индикаторных вида для старых и девственных лесов (по: Kotiranta, Niemelä, 1996), что характеризует данный лесной массив как уникальный. Максимальное количество дереворазрушающих грибов (66 видов) отмечено на основной лесообразующей породе - ели.