Фауна водных макробеспозвоночных верховых болот рассматривается как совокупность фаун разных типов внутриболотных водоёмов. Исследование выполнялось в 2012–2014 гг. на двух крупных водно-болотных угодьях: Шиченгское и Алексеевское-1 (Вологодская область). Пробы отбирались с мая по сентябрь в болотных озерках, межкочьях проточной топи, болотном ручье, двух внутриболотных озёрах. Всего в составе зоофитоса и зообентоса обнаружено 116 видов и таксонов более высокого ранга (71 таксон определён до вида, 25 – до рода) из 5 типов, 7 классов. Преобладают насекомые (88 видов, в том числе 55 – двукрылые, 14 – стрекозы, 8 – жуки, 5 – ручейники), остальные группы малочисленны (в том числе, олигохеты – 12 видов, пиявки – 6, моллюски – 5). Наибольшее количество видов зарегистрировано в пределах Шиченгского водно-болотного угодья – 104, из которых 81 отмечены в границах ландшафтного заказника «Шиченгский». Состав фауны и её структура зависит от типа болотного водного объекта. В ручье преобладают амфибиотические насекомые, в топи основную роль играют олигохеты и хирономиды. В озёрах доминируют моллюски и пиявки. Наиболее специфичны сообщества болотных озерков, в которых преобладают стрекозы и хирономиды. Сходство фаун разнотипных водоёмов минимально. При анализе трофической структуры наибольшую численность имеют мирные полифаги, наибольшую биомассу – хищники. Последние широко представлены в большинстве изученных водных объектов, что отличает их от неболотных. Наиболее благоприятные условия для водных беспозвоночных складываются во внутриболотных озёрах.